Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RCE1Q9Y256 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms