Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IGSF9BQ9UPX0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 370.7 ms