Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC12A4Q9UP95 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms