Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms