Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RABGEF1Q9UJ41 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1Q9UJ41 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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