Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGXB4Q9UGU5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms