Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN8Q9UBY8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms