Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS7AQ9UBW8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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