Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms