Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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