Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HACD3Q9P035 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms