Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCLQ9NW38 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms