Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCDHB16Q9NRJ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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