Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH2B1Q9NRF2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms