Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms