Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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