Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEBOXQ9HB31 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms