Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOJQ9H4E5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms