Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAB1BQ9H0U4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms