Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms