Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP2Q9BX26 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms