Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIRIP3Q9BW71 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIRIP3Q9BW71 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms