Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NDFIP1Q9BT67 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NDFIP1Q9BT67 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms