Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPKQ9BS16 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPKQ9BS16 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms