Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EBF4Q9BQW3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms