Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VRK1Q99986 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VRK1Q99986 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms