Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PITX2Q99697 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms