Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS8Q99627 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms