Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF12Q96QT6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms