Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC43Q96MW1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC43Q96MW1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms