Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP44Q96MT7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP44Q96MT7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms