Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM227BQ96M60 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms