Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKNOX2Q96KN3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKNOX2Q96KN3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms