Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS50Q96JG6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS50Q96JG6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms