Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIC2Q96JB3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms