Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MS4A3Q96HJ5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms