Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGF29Q96ES7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms