Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms