Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UPRTQ96BW1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms