Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PHGDH-204ENST00000469443 653 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-219ENST00000531348 582 ntTSL 217.39■□□□□ 0.373e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-209ENST00000506183 383 ntTSL 1 (best)16.9■□□□□ 0.31e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.243e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-206ENST00000526380 545 ntTSL 315.97■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.133e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-208ENST00000503726 488 ntTSL 215.62■□□□□ 0.091e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-204ENST00000356483 677 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.091e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-212ENST00000515540 300 ntTSL 315.13■□□□□ 0.011e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 EPS8L2-214ENST00000529680 551 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 514.66□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-12■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 TMEM63A-203ENST00000474478 5407 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 CYTH1-214ENST00000591095 1097 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ATXN7L3-210ENST00000591295 3017 ntTSL 512.86□□□□□ -0.353e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.363e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM2B-204ENST00000536036 500 ntTSL 212.58□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-220ENST00000560654 784 ntTSL 512.49□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-202ENST00000439231 1725 ntTSL 311.18□□□□□ -0.623e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-215ENST00000559963 794 ntTSL 210.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ADGRD1-211ENST00000541937 490 ntTSL 29.98□□□□□ -0.813e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 CYTH1-204ENST00000586043 836 ntTSL 39.53□□□□□ -0.883e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 39.51□□□□□ -0.893e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-208ENST00000559040 471 ntTSL 59.37□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-204ENST00000558145 567 ntTSL 49.12□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-206ENST00000558775 813 ntTSL 38.77□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 38.31□□□□□ -1.083e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 37.93□□□□□ -1.143e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GALK2-207ENST00000558956 641 ntTSL 57.09□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 56.83□□□□□ -1.323e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 CYTH1-211ENST00000589768 988 ntTSL 36.58□□□□□ -1.363e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 HNRNPC-215ENST00000555127 929 ntTSL 26.37□□□□□ -1.393e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.393e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GBE1-203ENST00000484687 863 ntTSL 26.18□□□□□ -1.423e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 25.82□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.783e-11■■■■■ 36.6
TBRG4Q969Z0 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 36.5
TBRG4Q969Z0 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 36.5
TBRG4Q969Z0 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 36.5
TBRG4Q969Z0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 36.5
TBRG4Q969Z0 PLCB1-213ENST00000626114 598 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 36.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53.58□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 36.4
TBRG4Q969Z0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 29.78□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-211ENST00000559423 895 ntTSL 59.72□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-218ENST00000560138 722 ntTSL 59.03□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-214ENST00000559883 991 ntTSL 48.77□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 GALK2-210ENST00000559208 861 ntTSL 57.33□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 36.3
TBRG4Q969Z0 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 AKAP6-202ENST00000553547 2274 ntTSL 27.99□□□□□ -1.138e-22■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.258e-22■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.518e-22■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.798e-22■■■■■ 36.2
TBRG4Q969Z0 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.464e-72■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 530.62■■■□□ 2.499e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.19e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 226.27■■□□□ 1.89e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 222.1■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 518.25■□□□□ 0.519e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 218.11■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 416.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 36.1
TBRG4Q969Z0 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 36.1
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 127.1 ms