Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD1Q8NHV4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms