Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK2A3Q8NEV1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms