Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGDNQ8NEJ9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms