Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST4Q8NCG5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST4Q8NCG5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST4Q8NCG5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHST4Q8NCG5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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