Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PNLDC1Q8NA58 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms