Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms