Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMER3Q8N944 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMER3Q8N944 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms