Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVOPQ8N4V2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms