Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF2Q8IX21 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms