Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX29P2Q8IUI4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms